2006年5月10日，国民党籍“立委”邱毅爆出陈水扁女婿赵建铭于2005年6、7月间，以母亲简水绵等人头，以每股新台币2元低价购入2万多张台开股票，不到一年净赚3、4亿。由此引出“台开内线交易案”。

　　5月12日，台湾彰化银行证实简水绵确实购买台开股票，台北检方指派检察官许永钦调查。

　　5月14日，邱毅指控，赵建铭与彰银高层参加三井宴。

　　5月18日，检方约谈蔡清文，并声押获准。

　　5月19日，检方约谈游世一，并声押获准。

　　5月20日，陈水扁为女婿赵建铭涉嫌台开案向全民道歉。

　　5月24日，赵建铭、赵玉柱、简水绵、赵建勋、程雅玲五人接受讯问。

　　5月25日，台北地院裁定羁押赵建铭。

　　5月26日，检调发现赵建铭涉嫌收贿“卖官”。

　　6月2日，蔡清文声请停押获准，当庭释放。

　　6月8日，赵建铭坦承他确实在三井餐会上，听见前台开董事长苏德建提及台开联贷案、出售信托部给日盛银行获利十六亿元等两项重大利多讯息。

　　7月10日，本案侦结，并且起诉赵建铭与其家人，共有十三人名列被告，赵建铭涉嫌内线交易情节重大，不法获利逾一亿元，具体求处有期徒刑八年(后被提高为九年)；陈水扁亲家赵玉柱涉嫌内线交易与侵占，求刑十年有期徒刑，并科罚金三千万元。

　　全案交由台北法院审理，10日晚间，赵建铭、游世一各以一千万元交保，苏德建以五百万元交保，三人限制出境。

　　7月28日，台北地方法院首度开庭，本案七名被告均出庭应讯。前国票金董事蔡清文是唯一承认部分犯罪事实的被告，其余六人均否认犯罪。

　　12月27日，全案一审宣判，赵建铭被判有期徒刑六年、并科罚金三千万元；赵玉柱判刑八年四个月、并科罚金三千万元；游世一、苏德建各判刑四年三个月，游世一并科罚金六千万元，蔡清文因向检方自白，捐出犯罪所得，求处两年，得以缓刑四年，另外两名被告耐斯企业陈镜尧被判两年、洪敏森判刑一年六个月。

　　法官认为，赵建铭为典型权贵型犯罪，与父亲赵玉柱内线交易实际获利所得约为五千四百余万元新台币。

　　判决书在引述《庄子·胠箧篇》后指出，赵建铭毕业于台大医学系，犯罪时为台大医院医师，且已有多年买卖股票经验，智识程度明显高于一般社会大众。他以陈水扁家庭成员身份介入公营事业之运作，显见品行尚非端正。

　　判决书表示，一般人储存脐带血必须自己缴纳高额费用，赵建铭将三位子女的脐带血送往储存，却可获得一千九百万元之代言费，相当于一般中、下阶层一、二十年薪资所得总额。

　　即使如此，赵建铭仍不知洁身自爱，利用权势获取影响台开公司股价的重要讯息，进场买卖台开股票后，获得巨额经济利益，是典型的权贵犯罪类型。以“拟制性交易所得”计算，其犯罪所得约为四百二十七万元。

　　判决书表示，赵建铭在“法院”审理时仅辩称“未注意自己身份，随便与人吃饭”，显见犯后仍毫无悔意，从重量处有期徒刑六年。

　　判决书也指出，赵玉柱为小学退休校长，却以陈水扁亲家的身份，四处兼任顾问及积极介入“关说”，还利用持有台湾省体育会捐助款的机会，加以侵占，又与自己的儿子以特定人买卖方式，自彰化银行购买股票获利。

　　而赵玉柱在“法院”审理期间，态度恶劣，毫无悔意，因此依内线交易、公益侵占罪从重量处有期徒刑五年六个月、三年，合并计算判刑八年四个月。

　　2007年6月26日，台开案二审作出宣判，赵建铭加重刑责被判七年有期徒刑，并罚款新台币三千万元。其父赵玉柱同样加重，被判九年六个月有期徒刑。